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我有一个数据集,本质上是一个稀疏二进制矩阵,表示两个集合的元素之间的关系。例如,让第一组是人(用他们的名字表示),例如像这样的东西:
people = set(['john','jane','mike','joe'])
第二组是一堆二进制属性,例如
attrs = set(['likes_coffee','has_curly_hair','has_dark_hair','drives_car','man_u_fan'])
数据集由制表符分隔的数据文件表示,该文件为每个人分配一些属性,例如
john likes_coffee
john drives_car
john has_curly_hair
jane has_curly_hair
jane man_u_fan
...
attrs
有大约 30,000
个元素,people
可以有 6,000,000
大,但数据稀疏,即每个人最多有30-40个属性
我正在寻找Python中的数据结构/类,它可以让我:
矩阵
对象{'has_curly_hair','likes_coffee','man_u_fan'}
的人员列表”{'mike','joe'}
的属性并集”我当前的实现使用一对数组来表示这两个集合和一个 scipy 稀疏矩阵。所以如果
people = ['john','jane','mike','joe']
attrs = ['likes_coffee','has_curly_hair','has_dark_hair','drives_car','man_u_fan']
然后我将创建一个大小为 4 X 5
的稀疏矩阵 data
,上面显示的示例数据将对应于元素
data[0,0]
data[0,3]
data[0,1]
data[1,1]
data[1,4]
...
我还维护两个逆索引,这样我就不必调用 people.index('mike')
或 attrs.index('has_curly_hair')
经常
这工作正常,但我必须明确维护索引。例如,当我有两个具有不同人员和/或属性集的数据集,并且我需要匹配两个稀疏矩阵中与同一人员/属性对应的行/列时,这很麻烦。
那么有没有一种替代方法可以让我避免使用整数索引,而是使用两个集合的实际元素来提取行/列,即类似于
data['john',:] # give me all attributes of 'john'
data[:,['has_curly_hair','drives_car']] # give me all people who 'has_curly_hair' or 'drives_car'
?
最佳答案
假设没有库完全满足您的要求,您可以创建自己的类 SparseMatrix
并重载运算符 []
。这是一种方法(构造函数可能与您想要的不同):
class SparseMatrix():
def __init__(self, x_label, y_label):
self.data = {}
for x,y in zip(x_label,y_label):
print x,y
self.data[x] = {}
for attr in y:
self.data[x][attr] = 1
return
def __getitem__(self, index):
x,y = index
if type(x) is str:
if type(y) is str:
return 1 if y in self.data[x] else 0
if type(y) is slice:
return self.data[x].keys()
if type(x) is slice:
if type(y) is str:
res = []
for key in self.data.keys():
if y in self.data[key]:
res.append(key)
return res
if type(y) is list:
res = []
for attr in y:
res += self.__getitem__((x,attr))
return res
在 REPL 中,我得到:
> data = SparseMatrix(['john','jane','mike','joe'],[['likes_coffee','has_curly_hair'],['has_dark_hair'],['drives_car'],['man_u_fan']])
> data['john',:]
['has_curly_hair', 'likes_coffee']
> data[:,['has_curly_hair','drives_car']]
['john', 'mike']
关于python:我可以在不(明确)使用整数索引的情况下获得稀疏矩阵表示吗?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/33617356/
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